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福建农林大学“作物遗传育种与综合利用”教育部重点实验室，是教育部与福建省人民政府省部共建重点实验室，于2008年10月获得教育部批准立项建设，2008年11月实验室建设计划任务通过专家论证，2011年12月召开第一届实验室学术委员会会议，2016年8月召开第二届学术委员会会议。实验室依托作物学和生物学一级学科，涵盖作物遗传育种国家(重点)培育学科，作物遗传育种农业部重点学科，作物遗传育种、作物栽培学与耕作学、生态学福建省211重点学科。
拥有作物学、生物学2个博士后流动工作站;财政部海峡两岸农产品品质基础实验室、两岸作物遗传育种实验室(中央与地方共建高校特色优势实验室)、农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室、农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点开放实验室、福建省水稻分子标记辅助育种重点实验室、福建省作物分子与细胞生物学重点实验室、作物应用遗传学福建省高校重点(开放)实验室、福建省高校农业生物技术重点实验室和作物生态与分子生理学福建省高等学校重点实验室等9个部省级重点实验室。
拥有农业部海峡两岸农业技术合作中心、科技部海峡两岸科技产业合作基地成员单位、国家甘蔗产业技术研发中心、国家糖料作物改良中心福州甘蔗分中心、农业部甘蔗及制品质量监督检验测试中心、农业部转基因(动、植物、微生物)成分检测中心、全国甘蔗引种检疫站、农业部东南黄红麻科学观测实验站、福建省特种作物育种与利用工程技术研究中心、福建省特种稻创新平台、福建省南方麻类种质资源共享平台和福建省甘蔗工程技术研究中心等12个国家和部省级研究中心、创新平台、实验站。
目前实验室共有研究人员83人，其中固定人员50人，流动人员33人，具有博士学位占87 %、海外留学经历的占46%、45岁以下青年教师占72%。其中，含国家有***讲座教授1人，优秀青年基金1人，突出贡献的中青年专家2人，全国杰出技术人才1人，教育部学部委员1人，农业部科技委委员1人，国家甘蔗产业技术体系首席科学家1人，甘蔗和麻类产业技术体系岗位科学家7人，享受***7人，农业部教材建设专家委员会委员3人，国家***万人才工程人选1人，福建***万人才工程人员2人，教育部新世纪优秀人才计划1人，福建省***计划1人，福建省高校新世纪优秀人才计划5人，福建省高等学校科技创新团队2个。
实验室在继承传统学科研究特色与优势的基础上，形成了多学科交叉融合、独具区域特色、符合经济建设和社会发展需要的4个重点研究方向：① 作物遗传与分子育种;② 粮食作物遗传育种与综合利用;③ 经济作物遗传育种与综合利用;④ 特用作物遗传育种与综合利用。
